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2004年12月21日

横浜市立大学大学院がポスト・ゲノム解析に日本HPのLinuxクラスタシステムを導入

- 408CPUの大規模クラスタで10倍の超高速処理を実現 -

日本ヒューレット・パッカード株式会社(略称:日本HP、本社:東京都品川区、社長:樋口 泰行)のLinuxハイパフォーマンスクラスタ「HP XC3000クラスタ(以下、XCクラスタ)」が、横浜市立大学(学長:小川 惠一)の大学院のポスト・ゲノム解析研究用に採用され、本格稼動を開始しました。横浜市立大学では、超並列処理による高速処理を行うため204ノード(408CPU)構成の大規模クラスタを導入し、以前の10倍以上の演算処理(2.4TFlops)が可能となりました。横浜市立大学は、日本初のHP XCクラスタの導入・稼動先となります。今回のシステム構築においては、クラスタ部分の構成、保守を日本HPが行い、システム全体の調達ならびにシステム・インテグレーション(SI)は日本HPとHPC(ハイパフォーマンス・コンピューティング)分野で提携関係にある住商エレクトロニクス株式会社が行いました。

横浜市立大学大学院総合理学研究科の生体超分子システム科学専攻は、ポスト・ゲノムといわれる生命現象に関わるタンパク質や遺伝情報を蓄えるDNAなどの構造と機能、またそれらの相互作用の解明を進める研究を行っています。XCクラスタは、同専攻の特に情報科学分野において、たんぱく質の立体構造に関する情報、分子シミュレーション法に基づく分子構造の予測や、遺伝子の一次構造に基づく遺伝子機能の解析に利用されます。同専攻ではより高速なタンパク質の構造解析、より大規模な分子シミュレーションを行うことのできるシステムが必要と判断し、この度のXCクラスタ導入となりました。

今回稼動したシステムの特長は以下の通りです。

 
最先端のHPCソフトウェアを採用
HPC分野では、仕様を公開し、自由に改良できるオープンソースソフトウェアが多く利用されています。XCクラスタには、検証を経たHPC向けオープンソースソフトウェアが組み込まれているため、最先端のHPC技術を取り込むことが可能です。また、日本HPが、オープンソースソフトウェアを採用したXCクラスタの保守サービスを提供するため、お客様は最先端のHPCクラスタシステムを安心して利用できます。
高い処理能力
今回のXCクラスタは、高い拡張性と信頼性を実現するHP ProLiant DL360サーバ192ノード及びDL380サーバ12ノードでシステムを構成しており、HPC分野で最適な高い処理性能を実現します。
安定したシステム稼動
HPC分野で豊富な実績のある日本HPがオープンソースソフトウェアを用いたXCクラスタの構成・保守サービスを提供します。また、HPC分野で豊富な実績のある住商エレクトロニクス株式会社が全体のSI及び運用管理サポートを提供するため、両社の協調による優れたシステムの安定稼動を実現します。
システムを一元化した管理製品により運用管理が容易
HPC分野で実績・定評のある管理操作画面及び操作性に優れたオープンソースソフトウェアをHPが検証・組み合わせ、クラスタシステムを一元的に管理できるように構成しています。

今回の新システムにより、3年前に導入した以前のシステムと比較して、同じ予算で演算処理性能が10倍以上になり、より高速な処理が可能となりました。また、管理が容易で運用コストが抑えられるため、お客様はシステムの運用管理に煩わされることなく、ITのコスト削減が可能になります。

<HPのHPC分野での実績>

 

2004年のIT専門調査会社IDCの調査によると、HPは2004年上半期で、全世界のHPC製品出荷金額第1位のベンダーであり、HPCクラスタ出荷金額も一位 (*1) を獲得しています。

(*1):  出典:IDC's Worldwide High-Performance Midrange and Technical Server QView, Sep. 1, 2004

■HP XC クラスタに関する情報は以下のURLを参照してください。
     http://www.hp.com/jp/hptc/

■ プレスルーム
     (画像データは以下のURLから「製品写真ライブラリ」をクリックしてご覧になれます。)
     http://www.hp.com/jp/pressroom/

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ホームページ:   http://www.hp.com/jp/directplus/

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